多数尿道结石是膀胱结石或上尿道结石排出过程中经过尿道时被阻或停留于尿道前列腺部、球部、阴茎部以及舟状窝或外尿道口处。少数病人的尿道结石是在尿道狭窄部近端或在尿道憩室内形成。
尿道结石的主要症状是疼痛、尿流梗阻和感染症状。一般为钝性疼痛，但也可以是锐利的，并常放射至阴茎头部。前尿道结石的疼痛常局限于结石嵌顿处，后尿道结石的疼痛常放射至会阴
或肛门。由于结石梗阻，尿流而变细，病人常能指明尿流受阻部位。对阴茎部尿道结石，病人常能扪及，并主诉在排尿时结石梗阻部尿道近侧隆起伴有胀痛。结石嵌顿于尿道、梗阻严重以及伴有感染时，可引起严重症状，如剧烈疼痛、结石嵌顿于尿道、急性尿潴留、尿外渗、会阴部脓肿及尿道瘘等。嵌顿于后尿道的结石偶尔可引起急性附睾炎症状如发烧、附睾肿大和疼痛。
位于尿道口及舟状窝的结石肉眼常能见到或扪及结石，前尿道结石都能触及，后尿道结石可经直肠指检时扪到。用金属探条检查尿道时能感到探条接触结石和结石摩擦音。
